Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdhr2E9Q7P9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdhr2E9Q7P9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms