Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp31E9Q6Y8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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