Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms