Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DspE9Q557 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DspE9Q557 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms