Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3250E9Q1M3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3250E9Q1M3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms