Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx60E9PZQ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx60E9PZQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx60E9PZQ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx60E9PZQ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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