Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Srp54bE9PXC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srp54bE9PXC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms