Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim30dE9PWL0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim30dE9PWL0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms