Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Abca16E9PWJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Abca16E9PWJ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Abca16E9PWJ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms