Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931429L15RikE9PVU2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931429L15RikE9PVU2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms