Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim5E9PV98 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Trim5E9PV98 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim5E9PV98 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms