Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clca3bE9PUL3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clca3bE9PUL3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms