Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc18b1D3Z5L6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc18b1D3Z5L6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms