Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nkx6-2D3Z4R4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms