Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
3425401B19RikD3Z1D3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
3425401B19RikD3Z1D3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms