Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf217D3YYI7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf217D3YYI7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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