Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc170D3YXL0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc170D3YXL0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc170D3YXL0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms