Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc13D3YV10 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc13D3YV10 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc13D3YV10 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms