Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmf1B9EKI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmf1B9EKI3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms