Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Phf11cB4XVP9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms