Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cspp1B2RX88 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms