Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AU015836B2RUM3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AU015836B2RUM3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms