Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zscan5bB2RTN3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zscan5bB2RTN3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms