Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ythdc2B2RR83 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ythdc2B2RR83 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ythdc2B2RR83 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc2B2RR83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc2B2RR83 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc2B2RR83 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc2B2RR83 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ythdc2B2RR83 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms