Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uhrf1bp1B2KF50 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms