Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr29B1ARI9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr29B1ARI9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr29B1ARI9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prr29B1ARI9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Prr29B1ARI9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prr29B1ARI9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms