Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tmem238A9JSM3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem238A9JSM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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