Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Skint2A7XUX6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Skint2A7XUX6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms