Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prss40A6H6T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prss40A6H6T1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prss40A6H6T1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms