Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Odf2A3KGV1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Odf2A3KGV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Odf2A3KGV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms