Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttll9A2APC3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttll9A2APC3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms