Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GabreA2AMW3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GabreA2AMW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms