Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc183A2AJB1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc183A2AJB1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc183A2AJB1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms