Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm12A2AJ77 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm12A2AJ77 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prdm12A2AJ77 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms