Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hmcn2A2AJ76 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Hmcn2A2AJ76 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Hmcn2A2AJ76 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Hmcn2A2AJ76 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Hmcn2A2AJ76 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hmcn2A2AJ76 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms