Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd4A2AFR3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Frmpd4A2AFR3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms