Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prdm16A2A935 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Prdm16A2A935 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prdm16A2A935 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prdm16A2A935 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms