Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd5A2A8L1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd5A2A8L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd5A2A8L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms