Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb4A2A863 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Itgb4A2A863 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb4A2A863 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms