Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam71e1A1L3C1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam71e1A1L3C1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms