Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trav12-2A0N8N6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trav12-2A0N8N6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trav12-2A0N8N6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms