Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms