Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ino80eA0A0U1RP99 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms