Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
1700028J19RikA0A0U1RP08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms