Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
A0A0U1RNP2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0U1RNP2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms