Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3550W4VSN7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3550W4VSN7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms