Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt6bQ9Z331 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krt6bQ9Z331 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms