Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Top3bQ9Z321 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Top3bQ9Z321 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms