Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Krt27Q9Z320 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Krt27Q9Z320 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Krt27Q9Z320 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms