Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Homer1Q9Z2Y3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Homer1Q9Z2Y3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Homer1Q9Z2Y3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms